问题描述
在Jenkins中使用了GitHub Pull Request Builder插件，但在构建过程中遇到了问题。他在构建中首先添加了一个步骤来设置JIRA_ISSUE变量，然后在构建的下一步中更新这些JIRA问题。然而，当他创建PR并触发构建时，发现JIRA_ISSUES变量没有被正确设置。
解决方案
用户在使用Jenkins和JIRA插件时遇到了问题，主要是关于JIRA_ISSUES变量的设置。以下是解决问题的步骤：
步骤1：检查JIRA_ISSUES变量设置
首先，需要检查你的构建步骤，确保你正确设置了JIRA_ISSUES变量。这通常通过使用JiraEnvironmentVariableBuilder插件来实现。确保你按照正确的方式配置了该插件，以从版本控制系统的更改日志中提取JIRA信息，并将其设置为环境变量。
步骤2：检查构建步骤顺序
你提到你的构建中有两个步骤：首先是设置JIRA_ISSUES变量，然后是更新这些JIRA问题。确保这两个步骤的顺序是正确的，即先设置变量，然后再使用变量进行后续操作。
步骤3：检查插件版本
确保你使用的JiraEnvironmentVariableBuilder插件版本是兼容的。有时插件的不同版本可能会导致问题。如果你的插件版本较旧，可以尝试升级到较新的版本，看看问题是否得到解决。
步骤4：查看构建日志和报错信息
在构建过程中，查看Jenkins的构建日志以及任何报错信息。这些信息可能会提供有关问题所在的线索。如果有错误信息，尝试根据错误信息来识别问题的原因。
步骤5：使用Pipeline进行构建
你提到已将任务迁移到了Pipeline中，并在其中运行了循环来处理所有的JIRA问题。使用Pipeline可以更好地管理构建过程，确保步骤的顺序和执行得到正确控制。确保你的Pipeline正确配置，并检查循环的逻辑以及JIRA问题的处理是否正确。
步骤6：更新插件或提交问题
如果尝试了上述步骤后问题仍未解决，可以考虑提交问题到插件的维护者，或者尝试升级插件到最新版本，看看是否有已知的问题修复。
总结
在Jenkins中使用JIRA插件时，正确设置JIRA_ISSUES变量非常重要，这涉及到构建步骤的配置和顺序。同时，确保你的插件版本是兼容的，并且查看构建日志以及报错信息可以帮助你更好地定位和解决问题。如果需要，可以使用Pipeline来更好地管理构建过程。如果问题仍然存在，可以考虑与插件的维护者联系或尝试其他解决方法。
请注意，本解决方案是基于提供的问题描述和我现有的知识进行的。如果问题与特定版本的插件或工具有关，建议查阅相关文档或寻求更专业的帮助。